Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmod1P49813 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmod1P49813 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmod1P49813 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmod1P49813 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmod1P49813 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmod1P49813 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmod1P49813 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmod1P49813 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmod1P49813 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmod1P49813 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmod1P49813 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmod1P49813 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmod1P49813 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmod1P49813 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmod1P49813 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmod1P49813 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmod1P49813 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmod1P49813 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmod1P49813 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmod1P49813 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmod1P49813 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmod1P49813 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmod1P49813 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Tmod1P49813 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmod1P49813 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmod1P49813 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmod1P49813 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmod1P49813 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmod1P49813 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmod1P49813 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmod1P49813 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmod1P49813 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmod1P49813 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmod1P49813 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmod1P49813 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmod1P49813 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmod1P49813 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmod1P49813 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmod1P49813 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmod1P49813 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmod1P49813 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmod1P49813 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmod1P49813 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmod1P49813 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmod1P49813 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmod1P49813 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmod1P49813 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmod1P49813 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmod1P49813 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmod1P49813 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmod1P49813 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmod1P49813 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmod1P49813 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmod1P49813 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmod1P49813 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmod1P49813 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmod1P49813 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmod1P49813 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmod1P49813 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmod1P49813 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmod1P49813 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmod1P49813 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmod1P49813 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmod1P49813 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Tmod1P49813 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmod1P49813 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tmod1P49813 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Tmod1P49813 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmod1P49813 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tmod1P49813 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tmod1P49813 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms