Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Epb42P49222 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Epb42P49222 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Epb42P49222 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Epb42P49222 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Epb42P49222 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Epb42P49222 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Epb42P49222 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Epb42P49222 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Epb42P49222 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Epb42P49222 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epb42P49222 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Epb42P49222 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epb42P49222 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epb42P49222 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epb42P49222 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epb42P49222 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epb42P49222 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epb42P49222 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epb42P49222 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epb42P49222 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epb42P49222 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Epb42P49222 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Epb42P49222 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Epb42P49222 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Epb42P49222 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Epb42P49222 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Epb42P49222 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb42P49222 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb42P49222 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb42P49222 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb42P49222 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb42P49222 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb42P49222 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb42P49222 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb42P49222 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Epb42P49222 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb42P49222 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epb42P49222 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epb42P49222 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epb42P49222 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epb42P49222 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Epb42P49222 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epb42P49222 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epb42P49222 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb42P49222 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb42P49222 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb42P49222 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb42P49222 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Epb42P49222 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Epb42P49222 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Epb42P49222 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Epb42P49222 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Epb42P49222 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Epb42P49222 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Epb42P49222 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Epb42P49222 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Epb42P49222 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Epb42P49222 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Epb42P49222 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Epb42P49222 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Epb42P49222 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Epb42P49222 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Epb42P49222 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Epb42P49222 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Epb42P49222 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Epb42P49222 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Epb42P49222 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Epb42P49222 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Epb42P49222 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Epb42P49222 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Epb42P49222 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Epb42P49222 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Epb42P49222 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Epb42P49222 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Epb42P49222 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Epb42P49222 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Epb42P49222 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Epb42P49222 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Epb42P49222 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Epb42P49222 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Epb42P49222 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Epb42P49222 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms