Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CitP49025 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CitP49025 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CitP49025 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CitP49025 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CitP49025 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CitP49025 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CitP49025 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CitP49025 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CitP49025 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CitP49025 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CitP49025 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CitP49025 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CitP49025 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CitP49025 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CitP49025 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CitP49025 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CitP49025 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CitP49025 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CitP49025 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CitP49025 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CitP49025 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CitP49025 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CitP49025 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CitP49025 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CitP49025 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CitP49025 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CitP49025 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CitP49025 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CitP49025 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CitP49025 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CitP49025 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CitP49025 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CitP49025 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CitP49025 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CitP49025 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CitP49025 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CitP49025 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CitP49025 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CitP49025 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CitP49025 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CitP49025 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CitP49025 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CitP49025 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CitP49025 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CitP49025 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CitP49025 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CitP49025 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CitP49025 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CitP49025 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CitP49025 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CitP49025 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CitP49025 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CitP49025 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CitP49025 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CitP49025 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CitP49025 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CitP49025 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CitP49025 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CitP49025 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CitP49025 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CitP49025 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CitP49025 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CitP49025 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CitP49025 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CitP49025 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CitP49025 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CitP49025 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CitP49025 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CitP49025 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CitP49025 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CitP49025 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CitP49025 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CitP49025 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CitP49025 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CitP49025 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CitP49025 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CitP49025 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CitP49025 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CitP49025 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CitP49025 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CitP49025 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CitP49025 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CitP49025 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CitP49025 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CitP49025 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CitP49025 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CitP49025 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CitP49025 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CitP49025 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CitP49025 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CitP49025 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CitP49025 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CitP49025 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CitP49025 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CitP49025 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CitP49025 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CitP49025 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CitP49025 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CitP49025 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms