Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Epb41P48193 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Epb41P48193 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Epb41P48193 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Epb41P48193 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Epb41P48193 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Epb41P48193 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Epb41P48193 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Epb41P48193 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Epb41P48193 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Epb41P48193 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Epb41P48193 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Epb41P48193 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Epb41P48193 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Epb41P48193 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Epb41P48193 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Epb41P48193 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Epb41P48193 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Epb41P48193 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Epb41P48193 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Epb41P48193 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Epb41P48193 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Epb41P48193 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epb41P48193 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41P48193 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41P48193 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Epb41P48193 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Epb41P48193 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Epb41P48193 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Epb41P48193 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Epb41P48193 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb41P48193 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb41P48193 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb41P48193 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb41P48193 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb41P48193 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Epb41P48193 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41P48193 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41P48193 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41P48193 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41P48193 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41P48193 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41P48193 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Epb41P48193 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Epb41P48193 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Epb41P48193 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epb41P48193 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb41P48193 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb41P48193 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41P48193 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41P48193 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Epb41P48193 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb41P48193 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epb41P48193 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms