Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbx2P48031 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbx2P48031 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbx2P48031 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbx2P48031 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbx2P48031 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbx2P48031 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbx2P48031 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbx2P48031 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbx2P48031 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbx2P48031 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbx2P48031 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gbx2P48031 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbx2P48031 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbx2P48031 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbx2P48031 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbx2P48031 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbx2P48031 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbx2P48031 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbx2P48031 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbx2P48031 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbx2P48031 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbx2P48031 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbx2P48031 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbx2P48031 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbx2P48031 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbx2P48031 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbx2P48031 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbx2P48031 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbx2P48031 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbx2P48031 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbx2P48031 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms