Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Resp18P47939 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Resp18P47939 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Resp18P47939 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Resp18P47939 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Resp18P47939 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Resp18P47939 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Resp18P47939 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Resp18P47939 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Resp18P47939 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Resp18P47939 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Resp18P47939 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Resp18P47939 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Resp18P47939 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Resp18P47939 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Resp18P47939 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Resp18P47939 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Resp18P47939 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Resp18P47939 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Resp18P47939 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Resp18P47939 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Resp18P47939 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms