Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scg3P47867 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scg3P47867 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scg3P47867 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scg3P47867 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scg3P47867 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scg3P47867 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scg3P47867 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scg3P47867 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scg3P47867 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scg3P47867 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scg3P47867 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scg3P47867 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scg3P47867 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scg3P47867 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scg3P47867 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scg3P47867 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scg3P47867 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scg3P47867 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scg3P47867 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scg3P47867 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scg3P47867 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scg3P47867 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scg3P47867 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scg3P47867 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scg3P47867 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scg3P47867 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scg3P47867 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scg3P47867 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scg3P47867 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scg3P47867 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scg3P47867 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scg3P47867 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scg3P47867 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Scg3P47867 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scg3P47867 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scg3P47867 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scg3P47867 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scg3P47867 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scg3P47867 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scg3P47867 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scg3P47867 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scg3P47867 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scg3P47867 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scg3P47867 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Scg3P47867 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Scg3P47867 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scg3P47867 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scg3P47867 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scg3P47867 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scg3P47867 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scg3P47867 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Scg3P47867 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scg3P47867 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Scg3P47867 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scg3P47867 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scg3P47867 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scg3P47867 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scg3P47867 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scg3P47867 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scg3P47867 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scg3P47867 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scg3P47867 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scg3P47867 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scg3P47867 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scg3P47867 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Scg3P47867 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scg3P47867 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scg3P47867 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scg3P47867 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scg3P47867 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scg3P47867 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scg3P47867 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scg3P47867 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scg3P47867 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scg3P47867 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scg3P47867 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scg3P47867 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Scg3P47867 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scg3P47867 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scg3P47867 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scg3P47867 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scg3P47867 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scg3P47867 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scg3P47867 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152 ms