Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SrprbP47758 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SrprbP47758 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SrprbP47758 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SrprbP47758 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SrprbP47758 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SrprbP47758 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SrprbP47758 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SrprbP47758 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SrprbP47758 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SrprbP47758 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SrprbP47758 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SrprbP47758 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SrprbP47758 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SrprbP47758 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SrprbP47758 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SrprbP47758 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SrprbP47758 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SrprbP47758 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SrprbP47758 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SrprbP47758 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SrprbP47758 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SrprbP47758 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SrprbP47758 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SrprbP47758 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SrprbP47758 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SrprbP47758 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SrprbP47758 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SrprbP47758 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SrprbP47758 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SrprbP47758 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SrprbP47758 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SrprbP47758 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SrprbP47758 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SrprbP47758 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SrprbP47758 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SrprbP47758 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SrprbP47758 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SrprbP47758 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
SrprbP47758 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SrprbP47758 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SrprbP47758 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SrprbP47758 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SrprbP47758 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SrprbP47758 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SrprbP47758 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SrprbP47758 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SrprbP47758 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SrprbP47758 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SrprbP47758 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SrprbP47758 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SrprbP47758 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SrprbP47758 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SrprbP47758 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SrprbP47758 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SrprbP47758 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SrprbP47758 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SrprbP47758 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SrprbP47758 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SrprbP47758 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SrprbP47758 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SrprbP47758 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SrprbP47758 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SrprbP47758 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SrprbP47758 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SrprbP47758 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SrprbP47758 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SrprbP47758 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SrprbP47758 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SrprbP47758 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SrprbP47758 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SrprbP47758 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SrprbP47758 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SrprbP47758 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SrprbP47758 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SrprbP47758 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SrprbP47758 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SrprbP47758 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SrprbP47758 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SrprbP47758 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SrprbP47758 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SrprbP47758 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SrprbP47758 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SrprbP47758 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SrprbP47758 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SrprbP47758 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SrprbP47758 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SrprbP47758 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SrprbP47758 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SrprbP47758 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SrprbP47758 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SrprbP47758 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SrprbP47758 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SrprbP47758 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SrprbP47758 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SrprbP47758 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SrprbP47758 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SrprbP47758 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SrprbP47758 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SrprbP47758 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms