Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pax7P47239 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pax7P47239 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pax7P47239 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pax7P47239 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pax7P47239 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pax7P47239 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pax7P47239 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pax7P47239 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pax7P47239 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pax7P47239 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pax7P47239 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pax7P47239 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pax7P47239 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pax7P47239 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pax7P47239 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pax7P47239 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pax7P47239 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pax7P47239 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pax7P47239 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pax7P47239 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pax7P47239 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pax7P47239 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pax7P47239 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pax7P47239 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pax7P47239 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pax7P47239 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pax7P47239 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pax7P47239 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pax7P47239 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pax7P47239 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pax7P47239 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pax7P47239 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pax7P47239 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Pax7P47239 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pax7P47239 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pax7P47239 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pax7P47239 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pax7P47239 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pax7P47239 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pax7P47239 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pax7P47239 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pax7P47239 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pax7P47239 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pax7P47239 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pax7P47239 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pax7P47239 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pax7P47239 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pax7P47239 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pax7P47239 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pax7P47239 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pax7P47239 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pax7P47239 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pax7P47239 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pax7P47239 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pax7P47239 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pax7P47239 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pax7P47239 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pax7P47239 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pax7P47239 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pax7P47239 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pax7P47239 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pax7P47239 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax7P47239 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax7P47239 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax7P47239 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax7P47239 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax7P47239 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pax7P47239 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms