Protein–RNA interactions for Protein: P43346

Dck, Deoxycytidine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DckP43346 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DckP43346 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DckP43346 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DckP43346 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DckP43346 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DckP43346 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DckP43346 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DckP43346 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DckP43346 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DckP43346 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DckP43346 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DckP43346 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DckP43346 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DckP43346 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DckP43346 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DckP43346 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DckP43346 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DckP43346 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DckP43346 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DckP43346 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DckP43346 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DckP43346 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DckP43346 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DckP43346 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DckP43346 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DckP43346 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DckP43346 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DckP43346 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
DckP43346 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DckP43346 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DckP43346 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DckP43346 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DckP43346 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DckP43346 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DckP43346 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DckP43346 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DckP43346 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DckP43346 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DckP43346 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DckP43346 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DckP43346 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DckP43346 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DckP43346 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DckP43346 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DckP43346 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DckP43346 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DckP43346 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DckP43346 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DckP43346 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DckP43346 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DckP43346 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DckP43346 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DckP43346 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DckP43346 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DckP43346 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DckP43346 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DckP43346 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DckP43346 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DckP43346 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DckP43346 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DckP43346 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DckP43346 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DckP43346 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DckP43346 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DckP43346 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DckP43346 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DckP43346 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DckP43346 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DckP43346 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DckP43346 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DckP43346 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DckP43346 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DckP43346 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DckP43346 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DckP43346 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DckP43346 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DckP43346 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DckP43346 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DckP43346 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DckP43346 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DckP43346 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DckP43346 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DckP43346 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DckP43346 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DckP43346 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DckP43346 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DckP43346 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DckP43346 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DckP43346 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DckP43346 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DckP43346 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DckP43346 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DckP43346 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DckP43346 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DckP43346 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DckP43346 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DckP43346 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DckP43346 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DckP43346 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DckP43346 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms