Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Msh2P43247 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Msh2P43247 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Msh2P43247 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Msh2P43247 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Msh2P43247 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Msh2P43247 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Msh2P43247 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Msh2P43247 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Msh2P43247 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Msh2P43247 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Msh2P43247 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Msh2P43247 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Msh2P43247 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Msh2P43247 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Msh2P43247 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Msh2P43247 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Msh2P43247 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Msh2P43247 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Msh2P43247 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Msh2P43247 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Msh2P43247 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Msh2P43247 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Msh2P43247 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Msh2P43247 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msh2P43247 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msh2P43247 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msh2P43247 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msh2P43247 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msh2P43247 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msh2P43247 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msh2P43247 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Msh2P43247 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Msh2P43247 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Msh2P43247 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Msh2P43247 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Msh2P43247 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msh2P43247 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msh2P43247 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Msh2P43247 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Msh2P43247 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Msh2P43247 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Msh2P43247 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Msh2P43247 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Msh2P43247 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Msh2P43247 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Msh2P43247 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Msh2P43247 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Msh2P43247 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Msh2P43247 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Msh2P43247 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Msh2P43247 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Msh2P43247 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Msh2P43247 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Msh2P43247 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Msh2P43247 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Msh2P43247 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Msh2P43247 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Msh2P43247 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Msh2P43247 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Msh2P43247 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Msh2P43247 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Msh2P43247 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Msh2P43247 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Msh2P43247 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Msh2P43247 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Msh2P43247 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Msh2P43247 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msh2P43247 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msh2P43247 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msh2P43247 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msh2P43247 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msh2P43247 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Msh2P43247 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Msh2P43247 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Msh2P43247 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Msh2P43247 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Msh2P43247 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msh2P43247 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Msh2P43247 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Msh2P43247 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Msh2P43247 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Msh2P43247 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Msh2P43247 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msh2P43247 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msh2P43247 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msh2P43247 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msh2P43247 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msh2P43247 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Msh2P43247 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms