Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtgfrP43117 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtgfrP43117 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtgfrP43117 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgfrP43117 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgfrP43117 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtgfrP43117 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtgfrP43117 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtgfrP43117 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtgfrP43117 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgfrP43117 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgfrP43117 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtgfrP43117 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgfrP43117 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgfrP43117 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgfrP43117 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgfrP43117 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgfrP43117 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgfrP43117 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtgfrP43117 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtgfrP43117 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtgfrP43117 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtgfrP43117 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtgfrP43117 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtgfrP43117 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtgfrP43117 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtgfrP43117 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtgfrP43117 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtgfrP43117 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtgfrP43117 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgfrP43117 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgfrP43117 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtgfrP43117 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PtgfrP43117 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgfrP43117 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtgfrP43117 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtgfrP43117 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgfrP43117 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgfrP43117 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgfrP43117 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgfrP43117 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtgfrP43117 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PtgfrP43117 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtgfrP43117 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtgfrP43117 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms