Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-5P42582 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-5P42582 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-5P42582 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-5P42582 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-5P42582 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-5P42582 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nkx2-5P42582 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx2-5P42582 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx2-5P42582 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx2-5P42582 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx2-5P42582 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nkx2-5P42582 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nkx2-5P42582 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx2-5P42582 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nkx2-5P42582 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nkx2-5P42582 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nkx2-5P42582 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nkx2-5P42582 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx2-5P42582 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nkx2-5P42582 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nkx2-5P42582 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx2-5P42582 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx2-5P42582 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx2-5P42582 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx2-5P42582 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nkx2-5P42582 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nkx2-5P42582 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nkx2-5P42582 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nkx2-5P42582 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx2-5P42582 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx2-5P42582 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx2-5P42582 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx2-5P42582 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx2-5P42582 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx2-5P42582 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx2-5P42582 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx2-5P42582 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nkx2-5P42582 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx2-5P42582 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx2-5P42582 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx2-5P42582 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx2-5P42582 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx2-5P42582 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nkx2-5P42582 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nkx2-5P42582 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nkx2-5P42582 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx2-5P42582 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx2-5P42582 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx2-5P42582 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nkx2-5P42582 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nkx2-5P42582 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nkx2-5P42582 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx2-5P42582 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx2-5P42582 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx2-5P42582 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx2-5P42582 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx2-5P42582 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx2-5P42582 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx2-5P42582 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx2-5P42582 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx2-5P42582 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx2-5P42582 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx2-5P42582 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx2-5P42582 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx2-5P42582 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx2-5P42582 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx2-5P42582 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx2-5P42582 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx2-5P42582 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx2-5P42582 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx2-5P42582 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx2-5P42582 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx2-5P42582 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx2-5P42582 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx2-5P42582 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx2-5P42582 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx2-5P42582 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx2-5P42582 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx2-5P42582 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms