Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfsf9P41274 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfsf9P41274 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfsf9P41274 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfsf9P41274 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfsf9P41274 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfsf9P41274 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfsf9P41274 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfsf9P41274 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfsf9P41274 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfsf9P41274 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfsf9P41274 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnfsf9P41274 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfsf9P41274 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfsf9P41274 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfsf9P41274 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfsf9P41274 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfsf9P41274 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfsf9P41274 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfsf9P41274 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfsf9P41274 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfsf9P41274 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfsf9P41274 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfsf9P41274 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfsf9P41274 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfsf9P41274 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfsf9P41274 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfsf9P41274 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfsf9P41274 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfsf9P41274 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfsf9P41274 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfsf9P41274 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfsf9P41274 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfsf9P41274 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfsf9P41274 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfsf9P41274 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfsf9P41274 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfsf9P41274 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfsf9P41274 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfsf9P41274 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfsf9P41274 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfsf9P41274 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfsf9P41274 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf9P41274 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfsf9P41274 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfsf9P41274 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfsf9P41274 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfsf9P41274 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf9P41274 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf9P41274 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf9P41274 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfsf9P41274 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfsf9P41274 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfsf9P41274 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfsf9P41274 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfsf9P41274 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnfsf9P41274 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfsf9P41274 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfsf9P41274 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfsf9P41274 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfsf9P41274 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfsf9P41274 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfsf9P41274 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfsf9P41274 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf9P41274 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf9P41274 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf9P41274 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf9P41274 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfsf9P41274 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfsf9P41274 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfsf9P41274 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfsf9P41274 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfsf9P41274 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfsf9P41274 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf9P41274 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf9P41274 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf9P41274 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf9P41274 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf9P41274 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfsf9P41274 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf9P41274 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf9P41274 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfsf9P41274 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfsf9P41274 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfsf9P41274 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfsf9P41274 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms