Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grik2P39087 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grik2P39087 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grik2P39087 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grik2P39087 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grik2P39087 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grik2P39087 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grik2P39087 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grik2P39087 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grik2P39087 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grik2P39087 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grik2P39087 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Grik2P39087 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grik2P39087 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grik2P39087 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Grik2P39087 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Grik2P39087 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grik2P39087 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grik2P39087 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grik2P39087 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Grik2P39087 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grik2P39087 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grik2P39087 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grik2P39087 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grik2P39087 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grik2P39087 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grik2P39087 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Grik2P39087 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grik2P39087 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grik2P39087 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grik2P39087 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grik2P39087 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grik2P39087 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grik2P39087 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grik2P39087 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Grik2P39087 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grik2P39087 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grik2P39087 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Grik2P39087 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Grik2P39087 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grik2P39087 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Grik2P39087 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grik2P39087 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grik2P39087 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grik2P39087 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grik2P39087 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grik2P39087 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grik2P39087 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grik2P39087 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grik2P39087 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grik2P39087 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grik2P39087 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grik2P39087 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grik2P39087 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grik2P39087 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik2P39087 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik2P39087 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik2P39087 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grik2P39087 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grik2P39087 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grik2P39087 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grik2P39087 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grik2P39087 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Grik2P39087 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grik2P39087 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grik2P39087 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grik2P39087 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grik2P39087 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grik2P39087 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grik2P39087 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grik2P39087 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grik2P39087 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grik2P39087 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grik2P39087 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Grik2P39087 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grik2P39087 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grik2P39087 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Grik2P39087 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grik2P39087 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grik2P39087 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Grik2P39087 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Grik2P39087 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Grik2P39087 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grik2P39087 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grik2P39087 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grik2P39087 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Grik2P39087 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grik2P39087 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grik2P39087 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Grik2P39087 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Grik2P39087 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms