Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Cd22P35329 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cd22P35329 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cd22P35329 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Cd22P35329 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Cd22P35329 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Cd22P35329 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Cd22P35329 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Cd22P35329 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Cd22P35329 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Cd22P35329 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Cd22P35329 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Cd22P35329 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Cd22P35329 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Cd22P35329 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Cd22P35329 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Cd22P35329 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Cd22P35329 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cd22P35329 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cd22P35329 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Cd22P35329 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Cd22P35329 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Cd22P35329 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Cd22P35329 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Cd22P35329 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Cd22P35329 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Cd22P35329 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Cd22P35329 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Cd22P35329 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cd22P35329 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cd22P35329 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cd22P35329 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Cd22P35329 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Cd22P35329 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Cd22P35329 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cd22P35329 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Cd22P35329 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Cd22P35329 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cd22P35329 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cd22P35329 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cd22P35329 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Cd22P35329 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Cd22P35329 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Cd22P35329 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Cd22P35329 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cd22P35329 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cd22P35329 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cd22P35329 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cd22P35329 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Cd22P35329 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Cd22P35329 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Cd22P35329 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Cd22P35329 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Cd22P35329 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Cd22P35329 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Cd22P35329 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Cd22P35329 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Cd22P35329 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Cd22P35329 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Cd22P35329 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Cd22P35329 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Cd22P35329 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Cd22P35329 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Cd22P35329 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Cd22P35329 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Cd22P35329 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Cd22P35329 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Cd22P35329 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Cd22P35329 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Cd22P35329 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Cd22P35329 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Cd22P35329 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Cd22P35329 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Cd22P35329 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Cd22P35329 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Cd22P35329 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Cd22P35329 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Cd22P35329 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Cd22P35329 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Cd22P35329 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Cd22P35329 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Cd22P35329 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Cd22P35329 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,6 ms