Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp12P34960 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp12P34960 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp12P34960 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp12P34960 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp12P34960 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp12P34960 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp12P34960 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Mmp12P34960 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp12P34960 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp12P34960 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp12P34960 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp12P34960 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp12P34960 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp12P34960 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp12P34960 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp12P34960 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp12P34960 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp12P34960 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp12P34960 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp12P34960 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mmp12P34960 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp12P34960 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp12P34960 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp12P34960 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp12P34960 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp12P34960 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp12P34960 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp12P34960 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp12P34960 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp12P34960 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp12P34960 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp12P34960 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp12P34960 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp12P34960 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp12P34960 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp12P34960 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp12P34960 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp12P34960 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp12P34960 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mmp12P34960 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mmp12P34960 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mmp12P34960 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mmp12P34960 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mmp12P34960 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mmp12P34960 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp12P34960 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp12P34960 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mmp12P34960 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp12P34960 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp12P34960 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp12P34960 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp12P34960 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp12P34960 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp12P34960 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp12P34960 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mmp12P34960 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mmp12P34960 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mmp12P34960 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp12P34960 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp12P34960 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp12P34960 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp12P34960 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp12P34960 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp12P34960 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mmp12P34960 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mmp12P34960 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp12P34960 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp12P34960 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp12P34960 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp12P34960 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp12P34960 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp12P34960 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp12P34960 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp12P34960 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp12P34960 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp12P34960 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp12P34960 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp12P34960 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms