Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pola2P33611 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pola2P33611 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pola2P33611 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pola2P33611 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pola2P33611 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pola2P33611 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pola2P33611 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Pola2P33611 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pola2P33611 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pola2P33611 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pola2P33611 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pola2P33611 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pola2P33611 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pola2P33611 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pola2P33611 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pola2P33611 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pola2P33611 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pola2P33611 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pola2P33611 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola2P33611 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola2P33611 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola2P33611 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pola2P33611 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pola2P33611 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pola2P33611 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pola2P33611 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pola2P33611 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pola2P33611 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pola2P33611 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Pola2P33611 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pola2P33611 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pola2P33611 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pola2P33611 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pola2P33611 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pola2P33611 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pola2P33611 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pola2P33611 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pola2P33611 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pola2P33611 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Pola2P33611 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pola2P33611 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Pola2P33611 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pola2P33611 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pola2P33611 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pola2P33611 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pola2P33611 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pola2P33611 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pola2P33611 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pola2P33611 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola2P33611 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pola2P33611 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pola2P33611 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pola2P33611 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pola2P33611 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pola2P33611 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pola2P33611 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pola2P33611 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pola2P33611 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pola2P33611 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms