Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pola1P33609 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pola1P33609 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Pola1P33609 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Pola1P33609 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pola1P33609 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pola1P33609 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pola1P33609 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pola1P33609 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pola1P33609 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pola1P33609 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pola1P33609 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pola1P33609 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pola1P33609 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pola1P33609 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pola1P33609 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Pola1P33609 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Pola1P33609 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Pola1P33609 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Pola1P33609 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pola1P33609 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pola1P33609 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pola1P33609 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Pola1P33609 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Pola1P33609 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pola1P33609 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pola1P33609 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Pola1P33609 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pola1P33609 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pola1P33609 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pola1P33609 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pola1P33609 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pola1P33609 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pola1P33609 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pola1P33609 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pola1P33609 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Pola1P33609 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Pola1P33609 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Pola1P33609 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pola1P33609 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Pola1P33609 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pola1P33609 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pola1P33609 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pola1P33609 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pola1P33609 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pola1P33609 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pola1P33609 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Pola1P33609 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Pola1P33609 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Pola1P33609 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pola1P33609 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pola1P33609 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pola1P33609 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pola1P33609 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pola1P33609 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pola1P33609 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pola1P33609 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pola1P33609 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pola1P33609 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pola1P33609 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pola1P33609 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pola1P33609 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pola1P33609 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Pola1P33609 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pola1P33609 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pola1P33609 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pola1P33609 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pola1P33609 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pola1P33609 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pola1P33609 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Pola1P33609 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Pola1P33609 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Pola1P33609 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pola1P33609 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pola1P33609 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pola1P33609 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pola1P33609 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pola1P33609 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pola1P33609 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pola1P33609 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pola1P33609 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pola1P33609 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pola1P33609 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pola1P33609 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Pola1P33609 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pola1P33609 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pola1P33609 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pola1P33609 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Pola1P33609 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pola1P33609 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pola1P33609 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pola1P33609 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pola1P33609 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Pola1P33609 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pola1P33609 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pola1P33609 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Pola1P33609 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Pola1P33609 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Pola1P33609 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pola1P33609 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms