Protein–RNA interactions for Protein: P33534

Oprk1, Kappa-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprk1P33534 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Oprk1P33534 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Oprk1P33534 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms