Protein–RNA interactions for Protein: P33534

Oprk1, Kappa-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprk1P33534 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Oprk1P33534 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Oprk1P33534 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Oprk1P33534 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Oprk1P33534 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Oprk1P33534 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oprk1P33534 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Oprk1P33534 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Oprk1P33534 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Oprk1P33534 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms