Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msr1P30204 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msr1P30204 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msr1P30204 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msr1P30204 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msr1P30204 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msr1P30204 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msr1P30204 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msr1P30204 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msr1P30204 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msr1P30204 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msr1P30204 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msr1P30204 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msr1P30204 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msr1P30204 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msr1P30204 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msr1P30204 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msr1P30204 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msr1P30204 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msr1P30204 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msr1P30204 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msr1P30204 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Msr1P30204 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msr1P30204 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msr1P30204 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msr1P30204 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msr1P30204 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msr1P30204 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msr1P30204 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Msr1P30204 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Msr1P30204 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msr1P30204 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msr1P30204 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msr1P30204 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msr1P30204 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msr1P30204 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msr1P30204 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msr1P30204 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Msr1P30204 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Msr1P30204 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msr1P30204 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Msr1P30204 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Msr1P30204 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msr1P30204 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msr1P30204 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msr1P30204 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msr1P30204 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msr1P30204 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msr1P30204 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msr1P30204 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msr1P30204 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Msr1P30204 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msr1P30204 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msr1P30204 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msr1P30204 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msr1P30204 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Msr1P30204 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msr1P30204 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msr1P30204 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msr1P30204 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msr1P30204 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msr1P30204 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Msr1P30204 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msr1P30204 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msr1P30204 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msr1P30204 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msr1P30204 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msr1P30204 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msr1P30204 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msr1P30204 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msr1P30204 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msr1P30204 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msr1P30204 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msr1P30204 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msr1P30204 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Msr1P30204 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msr1P30204 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msr1P30204 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms