Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pabpc1P29341 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pabpc1P29341 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pabpc1P29341 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pabpc1P29341 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pabpc1P29341 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pabpc1P29341 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pabpc1P29341 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pabpc1P29341 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pabpc1P29341 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pabpc1P29341 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pabpc1P29341 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pabpc1P29341 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pabpc1P29341 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pabpc1P29341 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pabpc1P29341 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pabpc1P29341 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pabpc1P29341 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pabpc1P29341 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pabpc1P29341 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pabpc1P29341 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pabpc1P29341 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pabpc1P29341 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pabpc1P29341 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pabpc1P29341 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pabpc1P29341 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pabpc1P29341 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pabpc1P29341 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pabpc1P29341 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pabpc1P29341 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pabpc1P29341 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pabpc1P29341 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pabpc1P29341 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pabpc1P29341 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pabpc1P29341 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pabpc1P29341 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pabpc1P29341 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pabpc1P29341 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pabpc1P29341 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pabpc1P29341 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pabpc1P29341 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pabpc1P29341 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pabpc1P29341 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pabpc1P29341 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pabpc1P29341 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pabpc1P29341 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pabpc1P29341 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pabpc1P29341 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pabpc1P29341 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pabpc1P29341 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pabpc1P29341 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pabpc1P29341 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pabpc1P29341 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pabpc1P29341 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pabpc1P29341 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pabpc1P29341 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pabpc1P29341 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pabpc1P29341 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pabpc1P29341 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pabpc1P29341 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pabpc1P29341 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pabpc1P29341 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pabpc1P29341 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pabpc1P29341 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pabpc1P29341 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pabpc1P29341 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pabpc1P29341 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pabpc1P29341 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpc1P29341 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpc1P29341 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pabpc1P29341 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pabpc1P29341 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms