Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Col2a1P28481 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col2a1P28481 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col2a1P28481 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col2a1P28481 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col2a1P28481 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col2a1P28481 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Col2a1P28481 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col2a1P28481 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Col2a1P28481 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col2a1P28481 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col2a1P28481 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col2a1P28481 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col2a1P28481 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col2a1P28481 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col2a1P28481 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col2a1P28481 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Col2a1P28481 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col2a1P28481 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col2a1P28481 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col2a1P28481 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col2a1P28481 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col2a1P28481 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col2a1P28481 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col2a1P28481 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Col2a1P28481 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Col2a1P28481 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col2a1P28481 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col2a1P28481 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col2a1P28481 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col2a1P28481 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col2a1P28481 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col2a1P28481 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col2a1P28481 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col2a1P28481 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col2a1P28481 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col2a1P28481 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col2a1P28481 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col2a1P28481 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Col2a1P28481 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col2a1P28481 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Col2a1P28481 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col2a1P28481 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col2a1P28481 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col2a1P28481 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col2a1P28481 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Col2a1P28481 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col2a1P28481 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col2a1P28481 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col2a1P28481 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col2a1P28481 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col2a1P28481 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col2a1P28481 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col2a1P28481 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col2a1P28481 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col2a1P28481 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col2a1P28481 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col2a1P28481 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col2a1P28481 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Col2a1P28481 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Col2a1P28481 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col2a1P28481 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col2a1P28481 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col2a1P28481 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col2a1P28481 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col2a1P28481 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col2a1P28481 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col2a1P28481 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col2a1P28481 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col2a1P28481 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col2a1P28481 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col2a1P28481 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col2a1P28481 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col2a1P28481 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col2a1P28481 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col2a1P28481 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col2a1P28481 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col2a1P28481 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col2a1P28481 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col2a1P28481 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Col2a1P28481 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col2a1P28481 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col2a1P28481 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col2a1P28481 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col2a1P28481 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col2a1P28481 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col2a1P28481 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms