Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gjc1P28229 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gjc1P28229 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gjc1P28229 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Gjc1P28229 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gjc1P28229 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gjc1P28229 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjc1P28229 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjc1P28229 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjc1P28229 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjc1P28229 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjc1P28229 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjc1P28229 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjc1P28229 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjc1P28229 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjc1P28229 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjc1P28229 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjc1P28229 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjc1P28229 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjc1P28229 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjc1P28229 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjc1P28229 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjc1P28229 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjc1P28229 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gjc1P28229 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjc1P28229 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjc1P28229 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjc1P28229 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjc1P28229 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjc1P28229 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjc1P28229 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjc1P28229 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjc1P28229 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjc1P28229 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjc1P28229 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjc1P28229 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Gjc1P28229 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjc1P28229 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjc1P28229 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjc1P28229 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjc1P28229 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjc1P28229 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjc1P28229 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjc1P28229 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjc1P28229 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjc1P28229 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjc1P28229 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjc1P28229 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gjc1P28229 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gjc1P28229 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjc1P28229 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjc1P28229 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gjc1P28229 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gjc1P28229 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gjc1P28229 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gjc1P28229 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjc1P28229 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjc1P28229 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjc1P28229 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjc1P28229 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjc1P28229 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjc1P28229 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjc1P28229 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjc1P28229 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjc1P28229 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjc1P28229 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjc1P28229 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjc1P28229 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjc1P28229 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjc1P28229 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjc1P28229 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjc1P28229 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gjc1P28229 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.4 ms