Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pde6aP27664 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pde6aP27664 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pde6aP27664 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pde6aP27664 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pde6aP27664 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pde6aP27664 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Pde6aP27664 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pde6aP27664 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pde6aP27664 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pde6aP27664 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pde6aP27664 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pde6aP27664 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pde6aP27664 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pde6aP27664 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pde6aP27664 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pde6aP27664 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pde6aP27664 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Pde6aP27664 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pde6aP27664 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Pde6aP27664 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pde6aP27664 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pde6aP27664 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pde6aP27664 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Pde6aP27664 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pde6aP27664 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pde6aP27664 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pde6aP27664 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pde6aP27664 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pde6aP27664 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pde6aP27664 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pde6aP27664 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pde6aP27664 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pde6aP27664 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pde6aP27664 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Pde6aP27664 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pde6aP27664 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pde6aP27664 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pde6aP27664 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pde6aP27664 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pde6aP27664 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pde6aP27664 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pde6aP27664 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pde6aP27664 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pde6aP27664 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pde6aP27664 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pde6aP27664 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pde6aP27664 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pde6aP27664 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pde6aP27664 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Pde6aP27664 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Pde6aP27664 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pde6aP27664 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pde6aP27664 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pde6aP27664 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pde6aP27664 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pde6aP27664 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pde6aP27664 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pde6aP27664 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pde6aP27664 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Pde6aP27664 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Pde6aP27664 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pde6aP27664 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pde6aP27664 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pde6aP27664 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pde6aP27664 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pde6aP27664 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pde6aP27664 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pde6aP27664 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pde6aP27664 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pde6aP27664 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pde6aP27664 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pde6aP27664 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pde6aP27664 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pde6aP27664 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pde6aP27664 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pde6aP27664 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pde6aP27664 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pde6aP27664 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pde6aP27664 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pde6aP27664 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pde6aP27664 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Pde6aP27664 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pde6aP27664 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pde6aP27664 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pde6aP27664 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pde6aP27664 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pde6aP27664 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pde6aP27664 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pde6aP27664 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Pde6aP27664 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pde6aP27664 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pde6aP27664 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pde6aP27664 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pde6aP27664 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Pde6aP27664 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pde6aP27664 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pde6aP27664 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pde6aP27664 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pde6aP27664 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms