Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
H2afxP27661 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
H2afxP27661 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
H2afxP27661 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2afxP27661 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2afxP27661 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H2afxP27661 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
H2afxP27661 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H2afxP27661 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H2afxP27661 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H2afxP27661 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H2afxP27661 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H2afxP27661 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H2afxP27661 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H2afxP27661 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H2afxP27661 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2afxP27661 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
H2afxP27661 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H2afxP27661 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H2afxP27661 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H2afxP27661 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H2afxP27661 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H2afxP27661 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H2afxP27661 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H2afxP27661 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H2afxP27661 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
H2afxP27661 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
H2afxP27661 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2afxP27661 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2afxP27661 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2afxP27661 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2afxP27661 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2afxP27661 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2afxP27661 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2afxP27661 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2afxP27661 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2afxP27661 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2afxP27661 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2afxP27661 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2afxP27661 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H2afxP27661 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H2afxP27661 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
H2afxP27661 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H2afxP27661 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H2afxP27661 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
H2afxP27661 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2afxP27661 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2afxP27661 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2afxP27661 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2afxP27661 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2afxP27661 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2afxP27661 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2afxP27661 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
H2afxP27661 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H2afxP27661 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H2afxP27661 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H2afxP27661 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2afxP27661 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2afxP27661 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H2afxP27661 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
H2afxP27661 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H2afxP27661 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H2afxP27661 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H2afxP27661 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H2afxP27661 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H2afxP27661 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H2afxP27661 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H2afxP27661 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H2afxP27661 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H2afxP27661 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2afxP27661 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2afxP27661 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H2afxP27661 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H2afxP27661 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2afxP27661 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H2afxP27661 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H2afxP27661 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
H2afxP27661 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2afxP27661 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2afxP27661 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2afxP27661 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2afxP27661 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2afxP27661 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2afxP27661 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2afxP27661 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2afxP27661 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms