Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctnna1P26231 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctnna1P26231 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms