Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctnna1P26231 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctnna1P26231 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnna1P26231 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnna1P26231 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ctnna1P26231 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnna1P26231 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ctnna1P26231 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnna1P26231 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna1P26231 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctnna1P26231 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms