Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Xrcc6P23475 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Xrcc6P23475 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Xrcc6P23475 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Xrcc6P23475 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrcc6P23475 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrcc6P23475 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Xrcc6P23475 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Xrcc6P23475 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Xrcc6P23475 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Xrcc6P23475 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Xrcc6P23475 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Xrcc6P23475 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Xrcc6P23475 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Xrcc6P23475 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Xrcc6P23475 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Xrcc6P23475 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Xrcc6P23475 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Xrcc6P23475 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Xrcc6P23475 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Xrcc6P23475 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Xrcc6P23475 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Xrcc6P23475 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Xrcc6P23475 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Xrcc6P23475 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Xrcc6P23475 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Xrcc6P23475 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Xrcc6P23475 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Xrcc6P23475 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Xrcc6P23475 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Xrcc6P23475 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Xrcc6P23475 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Xrcc6P23475 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Xrcc6P23475 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Xrcc6P23475 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Xrcc6P23475 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Xrcc6P23475 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Xrcc6P23475 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Xrcc6P23475 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Xrcc6P23475 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Xrcc6P23475 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Xrcc6P23475 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Xrcc6P23475 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Xrcc6P23475 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Xrcc6P23475 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Xrcc6P23475 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Xrcc6P23475 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Xrcc6P23475 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrcc6P23475 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrcc6P23475 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Xrcc6P23475 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Xrcc6P23475 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Xrcc6P23475 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Xrcc6P23475 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Xrcc6P23475 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Xrcc6P23475 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms