Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gja1P23242 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja1P23242 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja1P23242 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja1P23242 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gja1P23242 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gja1P23242 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gja1P23242 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gja1P23242 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gja1P23242 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gja1P23242 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gja1P23242 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gja1P23242 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gja1P23242 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gja1P23242 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gja1P23242 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gja1P23242 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gja1P23242 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gja1P23242 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gja1P23242 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gja1P23242 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gja1P23242 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gja1P23242 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gja1P23242 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gja1P23242 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gja1P23242 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gja1P23242 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gja1P23242 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gja1P23242 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gja1P23242 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gja1P23242 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gja1P23242 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gja1P23242 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gja1P23242 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gja1P23242 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gja1P23242 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gja1P23242 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gja1P23242 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gja1P23242 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gja1P23242 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gja1P23242 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gja1P23242 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gja1P23242 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gja1P23242 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gja1P23242 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Gja1P23242 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gja1P23242 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gja1P23242 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gja1P23242 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gja1P23242 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gja1P23242 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gja1P23242 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja1P23242 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja1P23242 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja1P23242 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gja1P23242 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gja1P23242 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gja1P23242 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gja1P23242 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gja1P23242 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gja1P23242 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gja1P23242 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gja1P23242 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gja1P23242 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gja1P23242 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gja1P23242 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gja1P23242 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gja1P23242 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja1P23242 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gja1P23242 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gja1P23242 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gja1P23242 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja1P23242 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja1P23242 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja1P23242 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja1P23242 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja1P23242 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gja1P23242 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gja1P23242 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gja1P23242 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gja1P23242 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gja1P23242 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gja1P23242 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gja1P23242 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gja1P23242 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gja1P23242 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gja1P23242 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gja1P23242 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gja1P23242 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gja1P23242 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gja1P23242 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja1P23242 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja1P23242 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gja1P23242 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gja1P23242 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja1P23242 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja1P23242 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja1P23242 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja1P23242 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja1P23242 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms