Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Edn1P22387 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Edn1P22387 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Edn1P22387 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Edn1P22387 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Edn1P22387 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Edn1P22387 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Edn1P22387 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Edn1P22387 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Edn1P22387 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Edn1P22387 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Edn1P22387 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Edn1P22387 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Edn1P22387 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Edn1P22387 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edn1P22387 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edn1P22387 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Edn1P22387 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Edn1P22387 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Edn1P22387 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Edn1P22387 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Edn1P22387 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Edn1P22387 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Edn1P22387 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edn1P22387 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Edn1P22387 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Edn1P22387 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Edn1P22387 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Edn1P22387 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Edn1P22387 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Edn1P22387 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Edn1P22387 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Edn1P22387 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Edn1P22387 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Edn1P22387 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Edn1P22387 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Edn1P22387 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Edn1P22387 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Edn1P22387 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Edn1P22387 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Edn1P22387 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Edn1P22387 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Edn1P22387 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Edn1P22387 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Edn1P22387 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Edn1P22387 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edn1P22387 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edn1P22387 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edn1P22387 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edn1P22387 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edn1P22387 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms