Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcb1aP21447 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb1aP21447 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb1aP21447 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb1aP21447 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb1aP21447 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb1aP21447 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb1aP21447 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb1aP21447 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb1aP21447 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb1aP21447 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb1aP21447 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb1aP21447 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb1aP21447 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb1aP21447 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb1aP21447 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb1aP21447 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb1aP21447 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb1aP21447 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb1aP21447 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb1aP21447 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb1aP21447 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb1aP21447 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb1aP21447 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb1aP21447 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb1aP21447 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb1aP21447 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb1aP21447 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb1aP21447 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb1aP21447 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb1aP21447 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb1aP21447 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb1aP21447 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb1aP21447 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb1aP21447 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb1aP21447 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb1aP21447 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb1aP21447 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb1aP21447 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb1aP21447 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb1aP21447 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb1aP21447 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb1aP21447 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb1aP21447 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb1aP21447 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb1aP21447 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb1aP21447 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb1aP21447 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcb1aP21447 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb1aP21447 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb1aP21447 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb1aP21447 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb1aP21447 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb1aP21447 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb1aP21447 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb1aP21447 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb1aP21447 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb1aP21447 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb1aP21447 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb1aP21447 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcb1aP21447 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcb1aP21447 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb1aP21447 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb1aP21447 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb1aP21447 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb1aP21447 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb1aP21447 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb1aP21447 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb1aP21447 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb1aP21447 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb1aP21447 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms