Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BdnfP21237 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BdnfP21237 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BdnfP21237 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BdnfP21237 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BdnfP21237 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BdnfP21237 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BdnfP21237 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BdnfP21237 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BdnfP21237 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BdnfP21237 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BdnfP21237 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BdnfP21237 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BdnfP21237 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BdnfP21237 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BdnfP21237 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BdnfP21237 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BdnfP21237 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BdnfP21237 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BdnfP21237 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BdnfP21237 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BdnfP21237 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BdnfP21237 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BdnfP21237 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BdnfP21237 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BdnfP21237 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BdnfP21237 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BdnfP21237 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BdnfP21237 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BdnfP21237 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BdnfP21237 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BdnfP21237 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BdnfP21237 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BdnfP21237 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BdnfP21237 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BdnfP21237 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BdnfP21237 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BdnfP21237 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BdnfP21237 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BdnfP21237 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BdnfP21237 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BdnfP21237 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BdnfP21237 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BdnfP21237 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BdnfP21237 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BdnfP21237 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BdnfP21237 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BdnfP21237 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BdnfP21237 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BdnfP21237 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BdnfP21237 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BdnfP21237 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BdnfP21237 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BdnfP21237 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BdnfP21237 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BdnfP21237 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BdnfP21237 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BdnfP21237 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BdnfP21237 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BdnfP21237 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BdnfP21237 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BdnfP21237 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BdnfP21237 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BdnfP21237 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BdnfP21237 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BdnfP21237 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BdnfP21237 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BdnfP21237 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BdnfP21237 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BdnfP21237 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms