Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcaP20444 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcaP20444 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcaP20444 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcaP20444 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrkcaP20444 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PrkcaP20444 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcaP20444 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcaP20444 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcaP20444 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcaP20444 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcaP20444 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcaP20444 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcaP20444 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcaP20444 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcaP20444 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcaP20444 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcaP20444 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcaP20444 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcaP20444 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcaP20444 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcaP20444 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcaP20444 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcaP20444 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcaP20444 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcaP20444 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcaP20444 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcaP20444 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkcaP20444 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcaP20444 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcaP20444 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcaP20444 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcaP20444 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcaP20444 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcaP20444 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcaP20444 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcaP20444 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcaP20444 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcaP20444 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcaP20444 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcaP20444 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcaP20444 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcaP20444 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms