Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cox4i1P19783 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cox4i1P19783 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cox4i1P19783 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cox4i1P19783 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cox4i1P19783 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cox4i1P19783 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cox4i1P19783 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cox4i1P19783 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cox4i1P19783 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox4i1P19783 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox4i1P19783 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox4i1P19783 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cox4i1P19783 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cox4i1P19783 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cox4i1P19783 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cox4i1P19783 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cox4i1P19783 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cox4i1P19783 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cox4i1P19783 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cox4i1P19783 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox4i1P19783 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cox4i1P19783 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cox4i1P19783 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cox4i1P19783 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox4i1P19783 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox4i1P19783 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox4i1P19783 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox4i1P19783 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox4i1P19783 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox4i1P19783 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox4i1P19783 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cox4i1P19783 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cox4i1P19783 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cox4i1P19783 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cox4i1P19783 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cox4i1P19783 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cox4i1P19783 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cox4i1P19783 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cox4i1P19783 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cox4i1P19783 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cox4i1P19783 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cox4i1P19783 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox4i1P19783 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cox4i1P19783 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cox4i1P19783 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cox4i1P19783 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cox4i1P19783 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cox4i1P19783 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cox4i1P19783 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox4i1P19783 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox4i1P19783 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox4i1P19783 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cox4i1P19783 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cox4i1P19783 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cox4i1P19783 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cox4i1P19783 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cox4i1P19783 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cox4i1P19783 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cox4i1P19783 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cox4i1P19783 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cox4i1P19783 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cox4i1P19783 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cox4i1P19783 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms