Protein–RNA interactions for Protein: P18608

Hmgn1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn1P18608 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn1P18608 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn1P18608 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn1P18608 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn1P18608 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn1P18608 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgn1P18608 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgn1P18608 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn1P18608 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn1P18608 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn1P18608 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn1P18608 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgn1P18608 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgn1P18608 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgn1P18608 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn1P18608 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn1P18608 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn1P18608 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn1P18608 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgn1P18608 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgn1P18608 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn1P18608 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgn1P18608 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgn1P18608 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hmgn1P18608 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgn1P18608 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgn1P18608 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgn1P18608 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgn1P18608 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgn1P18608 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgn1P18608 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn1P18608 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgn1P18608 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgn1P18608 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgn1P18608 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgn1P18608 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgn1P18608 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn1P18608 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn1P18608 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgn1P18608 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgn1P18608 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgn1P18608 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn1P18608 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn1P18608 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgn1P18608 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgn1P18608 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgn1P18608 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgn1P18608 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hmgn1P18608 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgn1P18608 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgn1P18608 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgn1P18608 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgn1P18608 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgn1P18608 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgn1P18608 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgn1P18608 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hmgn1P18608 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgn1P18608 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgn1P18608 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgn1P18608 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgn1P18608 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgn1P18608 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgn1P18608 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgn1P18608 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgn1P18608 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms