Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P18533 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P18533 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P18533 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P18533 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P18533 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
P18533 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P18533 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P18533 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P18533 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P18533 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P18533 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
P18533 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
P18533 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P18533 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P18533 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P18533 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P18533 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P18533 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P18533 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P18533 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
P18533 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P18533 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P18533 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
P18533 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P18533 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
P18533 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P18533 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P18533 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P18533 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P18533 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P18533 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P18533 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
P18533 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P18533 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P18533 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P18533 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P18533 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P18533 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
P18533 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
P18533 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P18533 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P18533 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P18533 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P18533 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P18533 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P18533 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P18533 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P18533 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P18533 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P18533 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P18533 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P18533 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P18533 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P18533 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P18533 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P18533 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P18533 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P18533 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P18533 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P18533 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
P18533 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
P18533 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P18533 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P18533 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P18533 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P18533 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P18533 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
P18533 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P18533 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P18533 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P18533 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
P18533 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P18533 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P18533 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P18533 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P18533 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P18533 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P18533 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P18533 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P18533 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P18533 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P18533 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P18533 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P18533 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P18533 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P18533 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P18533 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P18533 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P18533 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P18533 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
P18533 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P18533 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P18533 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P18533 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P18533 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P18533 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P18533 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
P18533 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
P18533 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms