Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PcnaP17918 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PcnaP17918 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PcnaP17918 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PcnaP17918 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PcnaP17918 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PcnaP17918 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PcnaP17918 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PcnaP17918 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PcnaP17918 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PcnaP17918 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PcnaP17918 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PcnaP17918 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PcnaP17918 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PcnaP17918 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PcnaP17918 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PcnaP17918 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PcnaP17918 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcnaP17918 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcnaP17918 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcnaP17918 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PcnaP17918 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PcnaP17918 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PcnaP17918 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PcnaP17918 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PcnaP17918 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PcnaP17918 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PcnaP17918 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PcnaP17918 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcnaP17918 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcnaP17918 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcnaP17918 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PcnaP17918 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PcnaP17918 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PcnaP17918 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PcnaP17918 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PcnaP17918 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PcnaP17918 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PcnaP17918 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PcnaP17918 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PcnaP17918 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PcnaP17918 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PcnaP17918 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PcnaP17918 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PcnaP17918 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PcnaP17918 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PcnaP17918 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PcnaP17918 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PcnaP17918 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PcnaP17918 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PcnaP17918 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PcnaP17918 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PcnaP17918 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PcnaP17918 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PcnaP17918 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PcnaP17918 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcnaP17918 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcnaP17918 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcnaP17918 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcnaP17918 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcnaP17918 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PcnaP17918 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PcnaP17918 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PcnaP17918 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PcnaP17918 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PcnaP17918 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms