Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pou4f1P17208 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pou4f1P17208 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pou4f1P17208 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pou4f1P17208 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pou4f1P17208 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pou4f1P17208 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pou4f1P17208 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pou4f1P17208 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pou4f1P17208 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pou4f1P17208 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Pou4f1P17208 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pou4f1P17208 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pou4f1P17208 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pou4f1P17208 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pou4f1P17208 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pou4f1P17208 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pou4f1P17208 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pou4f1P17208 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pou4f1P17208 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pou4f1P17208 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pou4f1P17208 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pou4f1P17208 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pou4f1P17208 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pou4f1P17208 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pou4f1P17208 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pou4f1P17208 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pou4f1P17208 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pou4f1P17208 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pou4f1P17208 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pou4f1P17208 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pou4f1P17208 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pou4f1P17208 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pou4f1P17208 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pou4f1P17208 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pou4f1P17208 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pou4f1P17208 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pou4f1P17208 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pou4f1P17208 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pou4f1P17208 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pou4f1P17208 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pou4f1P17208 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pou4f1P17208 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pou4f1P17208 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pou4f1P17208 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pou4f1P17208 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pou4f1P17208 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pou4f1P17208 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pou4f1P17208 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pou4f1P17208 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pou4f1P17208 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pou4f1P17208 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pou4f1P17208 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pou4f1P17208 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms