Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Tgfb3P17125 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
Tgfb3P17125 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Tgfb3P17125 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Tgfb3P17125 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Tgfb3P17125 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Tgfb3P17125 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Tgfb3P17125 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Tgfb3P17125 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Tgfb3P17125 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Tgfb3P17125 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Tgfb3P17125 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Tgfb3P17125 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Tgfb3P17125 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Tgfb3P17125 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Tgfb3P17125 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Tgfb3P17125 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Tgfb3P17125 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Tgfb3P17125 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Tgfb3P17125 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Tgfb3P17125 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Tgfb3P17125 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Tgfb3P17125 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Tgfb3P17125 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Tgfb3P17125 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Tgfb3P17125 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Tgfb3P17125 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Tgfb3P17125 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Tgfb3P17125 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Tgfb3P17125 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Tgfb3P17125 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Tgfb3P17125 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Tgfb3P17125 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Tgfb3P17125 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Tgfb3P17125 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Tgfb3P17125 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24,63■■□□□ 1,53
Tgfb3P17125 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Tgfb3P17125 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Tgfb3P17125 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Tgfb3P17125 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Tgfb3P17125 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Tgfb3P17125 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Tgfb3P17125 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Tgfb3P17125 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Tgfb3P17125 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Tgfb3P17125 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Tgfb3P17125 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Tgfb3P17125 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Tgfb3P17125 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Tgfb3P17125 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Tgfb3P17125 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Tgfb3P17125 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Tgfb3P17125 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Tgfb3P17125 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Tgfb3P17125 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Tgfb3P17125 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Tgfb3P17125 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Tgfb3P17125 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Tgfb3P17125 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Tgfb3P17125 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Tgfb3P17125 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Tgfb3P17125 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Tgfb3P17125 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Tgfb3P17125 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Tgfb3P17125 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Tgfb3P17125 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Tgfb3P17125 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Tgfb3P17125 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Tgfb3P17125 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Tgfb3P17125 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Tgfb3P17125 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24,44■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,39■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,39■■□□□ 1,5
Tgfb3P17125 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Tgfb3P17125 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,39■■□□□ 1,49
Tgfb3P17125 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Tgfb3P17125 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Tgfb3P17125 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Tgfb3P17125 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Tgfb3P17125 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Tgfb3P17125 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
Tgfb3P17125 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Tgfb3P17125 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Tgfb3P17125 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Tgfb3P17125 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Tgfb3P17125 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms