Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-D1P14427 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-D1P14427 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-D1P14427 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-D1P14427 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-D1P14427 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-D1P14427 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-D1P14427 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-D1P14427 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-D1P14427 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-D1P14427 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-D1P14427 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-D1P14427 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-D1P14427 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-D1P14427 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-D1P14427 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-D1P14427 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-D1P14427 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-D1P14427 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-D1P14427 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-D1P14427 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-D1P14427 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-D1P14427 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-D1P14427 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-D1P14427 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-D1P14427 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-D1P14427 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-D1P14427 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-D1P14427 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-D1P14427 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-D1P14427 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-D1P14427 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-D1P14427 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-D1P14427 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-D1P14427 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-D1P14427 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-D1P14427 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-D1P14427 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-D1P14427 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-D1P14427 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-D1P14427 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-D1P14427 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-D1P14427 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-D1P14427 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-D1P14427 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-D1P14427 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-D1P14427 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-D1P14427 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-D1P14427 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-D1P14427 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-D1P14427 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-D1P14427 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-D1P14427 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-D1P14427 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms