Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scd1P13516 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scd1P13516 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scd1P13516 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scd1P13516 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scd1P13516 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scd1P13516 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scd1P13516 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scd1P13516 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scd1P13516 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scd1P13516 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scd1P13516 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scd1P13516 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scd1P13516 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scd1P13516 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scd1P13516 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scd1P13516 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scd1P13516 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scd1P13516 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scd1P13516 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scd1P13516 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scd1P13516 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scd1P13516 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scd1P13516 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scd1P13516 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Scd1P13516 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scd1P13516 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scd1P13516 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scd1P13516 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scd1P13516 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scd1P13516 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scd1P13516 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scd1P13516 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scd1P13516 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scd1P13516 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scd1P13516 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scd1P13516 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scd1P13516 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scd1P13516 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scd1P13516 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scd1P13516 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scd1P13516 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scd1P13516 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Scd1P13516 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scd1P13516 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scd1P13516 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scd1P13516 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scd1P13516 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scd1P13516 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scd1P13516 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scd1P13516 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scd1P13516 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scd1P13516 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scd1P13516 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scd1P13516 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scd1P13516 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scd1P13516 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scd1P13516 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scd1P13516 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scd1P13516 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scd1P13516 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scd1P13516 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scd1P13516 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scd1P13516 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scd1P13516 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scd1P13516 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scd1P13516 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scd1P13516 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scd1P13516 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Scd1P13516 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scd1P13516 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scd1P13516 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scd1P13516 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scd1P13516 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scd1P13516 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scd1P13516 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scd1P13516 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scd1P13516 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Scd1P13516 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scd1P13516 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scd1P13516 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scd1P13516 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scd1P13516 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scd1P13516 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scd1P13516 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scd1P13516 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scd1P13516 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scd1P13516 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scd1P13516 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scd1P13516 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scd1P13516 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scd1P13516 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scd1P13516 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scd1P13516 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scd1P13516 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scd1P13516 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scd1P13516 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scd1P13516 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scd1P13516 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scd1P13516 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms