Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcl2P10889 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcl2P10889 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcl2P10889 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxcl2P10889 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxcl2P10889 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxcl2P10889 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcl2P10889 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxcl2P10889 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxcl2P10889 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxcl2P10889 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcl2P10889 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcl2P10889 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cxcl2P10889 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcl2P10889 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcl2P10889 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cxcl2P10889 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcl2P10889 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcl2P10889 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcl2P10889 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcl2P10889 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcl2P10889 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcl2P10889 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cxcl2P10889 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxcl2P10889 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcl2P10889 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcl2P10889 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcl2P10889 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcl2P10889 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcl2P10889 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcl2P10889 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl2P10889 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl2P10889 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl2P10889 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl2P10889 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl2P10889 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl2P10889 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl2P10889 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl2P10889 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl2P10889 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcl2P10889 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcl2P10889 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms