Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Prf1P10820 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prf1P10820 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prf1P10820 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prf1P10820 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prf1P10820 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prf1P10820 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prf1P10820 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prf1P10820 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prf1P10820 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prf1P10820 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prf1P10820 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prf1P10820 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prf1P10820 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prf1P10820 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Prf1P10820 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Prf1P10820 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prf1P10820 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prf1P10820 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prf1P10820 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prf1P10820 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prf1P10820 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prf1P10820 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prf1P10820 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prf1P10820 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prf1P10820 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prf1P10820 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prf1P10820 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prf1P10820 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prf1P10820 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prf1P10820 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prf1P10820 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prf1P10820 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prf1P10820 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prf1P10820 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Prf1P10820 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prf1P10820 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prf1P10820 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prf1P10820 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prf1P10820 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prf1P10820 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prf1P10820 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prf1P10820 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Prf1P10820 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prf1P10820 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prf1P10820 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prf1P10820 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prf1P10820 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prf1P10820 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prf1P10820 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prf1P10820 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prf1P10820 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prf1P10820 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Prf1P10820 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prf1P10820 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prf1P10820 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prf1P10820 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prf1P10820 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prf1P10820 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prf1P10820 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prf1P10820 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prf1P10820 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prf1P10820 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prf1P10820 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prf1P10820 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prf1P10820 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prf1P10820 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prf1P10820 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prf1P10820 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prf1P10820 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prf1P10820 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prf1P10820 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prf1P10820 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prf1P10820 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prf1P10820 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prf1P10820 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prf1P10820 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prf1P10820 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prf1P10820 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prf1P10820 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prf1P10820 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Prf1P10820 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prf1P10820 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prf1P10820 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prf1P10820 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prf1P10820 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prf1P10820 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms