Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxb4P10284 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxb4P10284 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxb4P10284 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxb4P10284 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxb4P10284 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxb4P10284 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxb4P10284 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxb4P10284 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxb4P10284 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb4P10284 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb4P10284 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb4P10284 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb4P10284 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb4P10284 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb4P10284 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxb4P10284 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxb4P10284 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb4P10284 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb4P10284 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb4P10284 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb4P10284 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb4P10284 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb4P10284 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb4P10284 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb4P10284 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb4P10284 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb4P10284 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb4P10284 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb4P10284 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb4P10284 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb4P10284 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb4P10284 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb4P10284 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb4P10284 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxb4P10284 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb4P10284 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb4P10284 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb4P10284 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb4P10284 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb4P10284 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb4P10284 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb4P10284 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb4P10284 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb4P10284 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb4P10284 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb4P10284 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb4P10284 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb4P10284 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb4P10284 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb4P10284 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb4P10284 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb4P10284 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb4P10284 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb4P10284 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb4P10284 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb4P10284 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb4P10284 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb4P10284 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb4P10284 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb4P10284 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb4P10284 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb4P10284 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb4P10284 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb4P10284 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb4P10284 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb4P10284 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb4P10284 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb4P10284 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb4P10284 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb4P10284 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb4P10284 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms