Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf6P0C6B7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf6P0C6B7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf6P0C6B7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf6P0C6B7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf6P0C6B7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf6P0C6B7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf6P0C6B7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf6P0C6B7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf6P0C6B7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Igsf6P0C6B7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf6P0C6B7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Igsf6P0C6B7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igsf6P0C6B7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igsf6P0C6B7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igsf6P0C6B7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Igsf6P0C6B7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Igsf6P0C6B7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Igsf6P0C6B7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igsf6P0C6B7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Igsf6P0C6B7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igsf6P0C6B7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Igsf6P0C6B7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Igsf6P0C6B7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igsf6P0C6B7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igsf6P0C6B7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igsf6P0C6B7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igsf6P0C6B7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Igsf6P0C6B7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Igsf6P0C6B7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Igsf6P0C6B7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igsf6P0C6B7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igsf6P0C6B7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Igsf6P0C6B7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igsf6P0C6B7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igsf6P0C6B7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igsf6P0C6B7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igsf6P0C6B7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igsf6P0C6B7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igsf6P0C6B7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igsf6P0C6B7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Igsf6P0C6B7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Igsf6P0C6B7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Igsf6P0C6B7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Igsf6P0C6B7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms