Protein–RNA interactions for Protein: P09690

Chrnb1, Acetylcholine receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb1P09690 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrnb1P09690 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrnb1P09690 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrnb1P09690 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrnb1P09690 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrnb1P09690 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrnb1P09690 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrnb1P09690 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrnb1P09690 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrnb1P09690 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrnb1P09690 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrnb1P09690 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrnb1P09690 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrnb1P09690 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chrnb1P09690 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrnb1P09690 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrnb1P09690 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrnb1P09690 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrnb1P09690 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrnb1P09690 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrnb1P09690 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrnb1P09690 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrnb1P09690 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrnb1P09690 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrnb1P09690 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrnb1P09690 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrnb1P09690 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrnb1P09690 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrnb1P09690 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrnb1P09690 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrnb1P09690 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrnb1P09690 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrnb1P09690 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrnb1P09690 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chrnb1P09690 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrnb1P09690 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrnb1P09690 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrnb1P09690 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrnb1P09690 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrnb1P09690 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrnb1P09690 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrnb1P09690 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrnb1P09690 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrnb1P09690 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrnb1P09690 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrnb1P09690 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrnb1P09690 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrnb1P09690 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrnb1P09690 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrnb1P09690 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrnb1P09690 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrnb1P09690 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms