Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itgb1P09055 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itgb1P09055 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itgb1P09055 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itgb1P09055 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Itgb1P09055 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Itgb1P09055 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Itgb1P09055 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Itgb1P09055 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Itgb1P09055 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Itgb1P09055 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Itgb1P09055 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Itgb1P09055 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Itgb1P09055 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itgb1P09055 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itgb1P09055 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Itgb1P09055 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Itgb1P09055 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Itgb1P09055 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Itgb1P09055 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Itgb1P09055 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Itgb1P09055 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Itgb1P09055 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itgb1P09055 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itgb1P09055 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itgb1P09055 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itgb1P09055 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itgb1P09055 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itgb1P09055 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itgb1P09055 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Itgb1P09055 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itgb1P09055 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Itgb1P09055 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Itgb1P09055 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itgb1P09055 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb1P09055 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb1P09055 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itgb1P09055 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itgb1P09055 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itgb1P09055 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Itgb1P09055 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Itgb1P09055 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb1P09055 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb1P09055 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Itgb1P09055 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itgb1P09055 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itgb1P09055 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itgb1P09055 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgb1P09055 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgb1P09055 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgb1P09055 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb1P09055 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Itgb1P09055 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb1P09055 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itgb1P09055 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itgb1P09055 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Itgb1P09055 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Itgb1P09055 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itgb1P09055 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb1P09055 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itgb1P09055 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itgb1P09055 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itgb1P09055 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Itgb1P09055 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Itgb1P09055 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Itgb1P09055 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Itgb1P09055 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Itgb1P09055 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itgb1P09055 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itgb1P09055 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itgb1P09055 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Itgb1P09055 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb1P09055 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Itgb1P09055 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itgb1P09055 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itgb1P09055 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itgb1P09055 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itgb1P09055 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Itgb1P09055 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Itgb1P09055 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Itgb1P09055 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Itgb1P09055 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Itgb1P09055 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms