Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spta1P08032 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spta1P08032 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spta1P08032 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spta1P08032 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spta1P08032 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spta1P08032 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spta1P08032 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spta1P08032 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spta1P08032 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spta1P08032 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Spta1P08032 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spta1P08032 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spta1P08032 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spta1P08032 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spta1P08032 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spta1P08032 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spta1P08032 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spta1P08032 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spta1P08032 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spta1P08032 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spta1P08032 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spta1P08032 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spta1P08032 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spta1P08032 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spta1P08032 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spta1P08032 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spta1P08032 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spta1P08032 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Spta1P08032 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spta1P08032 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spta1P08032 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spta1P08032 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spta1P08032 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spta1P08032 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Spta1P08032 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spta1P08032 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spta1P08032 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spta1P08032 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spta1P08032 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spta1P08032 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spta1P08032 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spta1P08032 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spta1P08032 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spta1P08032 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spta1P08032 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spta1P08032 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spta1P08032 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spta1P08032 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spta1P08032 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Spta1P08032 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Spta1P08032 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spta1P08032 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spta1P08032 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spta1P08032 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spta1P08032 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Spta1P08032 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spta1P08032 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spta1P08032 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spta1P08032 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spta1P08032 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Spta1P08032 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spta1P08032 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spta1P08032 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spta1P08032 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spta1P08032 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spta1P08032 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spta1P08032 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spta1P08032 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Spta1P08032 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spta1P08032 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spta1P08032 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spta1P08032 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spta1P08032 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spta1P08032 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spta1P08032 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spta1P08032 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spta1P08032 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spta1P08032 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spta1P08032 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spta1P08032 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spta1P08032 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spta1P08032 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spta1P08032 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spta1P08032 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spta1P08032 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spta1P08032 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms