Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Hoxa7P02830 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Hoxa7P02830 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Hoxa7P02830 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Hoxa7P02830 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31,09■■■□□ 2,57
Hoxa7P02830 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Hoxa7P02830 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Hoxa7P02830 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Hoxa7P02830 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Hoxa7P02830 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Hoxa7P02830 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Hoxa7P02830 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Hoxa7P02830 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Hoxa7P02830 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Hoxa7P02830 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Hoxa7P02830 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Hoxa7P02830 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Hoxa7P02830 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Hoxa7P02830 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Hoxa7P02830 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Hoxa7P02830 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Hoxa7P02830 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Hoxa7P02830 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Hoxa7P02830 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Hoxa7P02830 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Hoxa7P02830 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Hoxa7P02830 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Hoxa7P02830 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Hoxa7P02830 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Hoxa7P02830 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Hoxa7P02830 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30,92■■■□□ 2,54
Hoxa7P02830 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Hoxa7P02830 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
Hoxa7P02830 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Hoxa7P02830 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30,89■■■□□ 2,54
Hoxa7P02830 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Hoxa7P02830 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Hoxa7P02830 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Hoxa7P02830 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Hoxa7P02830 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Hoxa7P02830 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Hoxa7P02830 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Hoxa7P02830 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Hoxa7P02830 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Hoxa7P02830 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Hoxa7P02830 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Hoxa7P02830 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Hoxa7P02830 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30,76■■■□□ 2,52
Hoxa7P02830 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Hoxa7P02830 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Hoxa7P02830 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Hoxa7P02830 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Hoxa7P02830 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Hoxa7P02830 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Hoxa7P02830 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Hoxa7P02830 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Hoxa7P02830 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Hoxa7P02830 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Hoxa7P02830 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Hoxa7P02830 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30,67■■■□□ 2,5
Hoxa7P02830 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Hoxa7P02830 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Hoxa7P02830 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Hoxa7P02830 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Hoxa7P02830 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Hoxa7P02830 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Hoxa7P02830 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Hoxa7P02830 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Hoxa7P02830 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Hoxa7P02830 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Hoxa7P02830 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Hoxa7P02830 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Hoxa7P02830 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30,59■■■□□ 2,49
Hoxa7P02830 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Hoxa7P02830 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Hoxa7P02830 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Hoxa7P02830 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Hoxa7P02830 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Hoxa7P02830 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Hoxa7P02830 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Hoxa7P02830 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Hoxa7P02830 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Hoxa7P02830 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Hoxa7P02830 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Hoxa7P02830 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Hoxa7P02830 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Hoxa7P02830 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Hoxa7P02830 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Hoxa7P02830 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Hoxa7P02830 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Hoxa7P02830 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Hoxa7P02830 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Hoxa7P02830 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Hoxa7P02830 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Hoxa7P02830 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Hoxa7P02830 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Hoxa7P02830 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Hoxa7P02830 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Hoxa7P02830 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,43■■■□□ 2,46
Hoxa7P02830 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms