Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Lamc1P02468 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Lamc1P02468 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Lamc1P02468 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Lamc1P02468 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Lamc1P02468 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Lamc1P02468 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Lamc1P02468 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Lamc1P02468 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Lamc1P02468 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Lamc1P02468 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Lamc1P02468 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Lamc1P02468 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Lamc1P02468 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Lamc1P02468 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Lamc1P02468 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Lamc1P02468 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Lamc1P02468 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Lamc1P02468 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Lamc1P02468 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Lamc1P02468 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Lamc1P02468 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Lamc1P02468 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Lamc1P02468 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Lamc1P02468 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Lamc1P02468 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Lamc1P02468 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Lamc1P02468 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lamc1P02468 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Lamc1P02468 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lamc1P02468 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lamc1P02468 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Lamc1P02468 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Lamc1P02468 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Lamc1P02468 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Lamc1P02468 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Lamc1P02468 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Lamc1P02468 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Lamc1P02468 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Lamc1P02468 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Lamc1P02468 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Lamc1P02468 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Lamc1P02468 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Lamc1P02468 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Lamc1P02468 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Lamc1P02468 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Lamc1P02468 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Lamc1P02468 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Lamc1P02468 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Lamc1P02468 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Lamc1P02468 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Lamc1P02468 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Lamc1P02468 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Lamc1P02468 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Lamc1P02468 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Lamc1P02468 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Lamc1P02468 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Lamc1P02468 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Lamc1P02468 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lamc1P02468 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lamc1P02468 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lamc1P02468 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lamc1P02468 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Lamc1P02468 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Lamc1P02468 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Lamc1P02468 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Lamc1P02468 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Lamc1P02468 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Lamc1P02468 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Lamc1P02468 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Lamc1P02468 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Lamc1P02468 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Lamc1P02468 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Lamc1P02468 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Lamc1P02468 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Lamc1P02468 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Lamc1P02468 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Lamc1P02468 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Lamc1P02468 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Lamc1P02468 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Lamc1P02468 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Lamc1P02468 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Lamc1P02468 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Lamc1P02468 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Lamc1P02468 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Lamc1P02468 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Lamc1P02468 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Lamc1P02468 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Lamc1P02468 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Lamc1P02468 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Lamc1P02468 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Lamc1P02468 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Lamc1P02468 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Lamc1P02468 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Lamc1P02468 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Lamc1P02468 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Lamc1P02468 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Lamc1P02468 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Lamc1P02468 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Lamc1P02468 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms